用板蓝根30克，煎水熏洗疣发处皮肤，每日2～3次，使用板蓝根注射液进行肌肉注射，每日2次，每次2毫升，注射两个星期为一个疗程，有治疗扁平疣的作用。
其他疗法还有：病毒灵，每次口服0.2克，每日3次，1个月为一疗程；磷酸氯奎，每日3次，第一次服0.125克，第二、三次服0.25克。用这种方法服1周后，从第二周开始，每次0.25克，每日2次，第三、四周每天只服0.25克，4周为一疗程；还可用维生素B12，每次100毫克，每日1次肌肉注射。一个疗程为30天。
此外，保持健康的心理状态，对治疗扁平疣也十分重要。即使患了扁平疣，也要心情舒畅，加上有效的中西医结合治疗，一定会使扁平疣得到治愈。