因附睾炎有急性与慢性之分，所以治疗也有所侧重。 对于急性附睾炎主张患者卧床休息，托起阴囊，以减轻疼痛。 早期可将冰袋放在附睾处，防止肿胀。晚期可用热敷，以促进局部血运，加速炎症消退。因属于感染，故应进行抗感染治疗，临床上多选用广谱抗生素及对革兰氏阴性菌效果较佳的抗生素。对于疼痛、发热等全身症状，应用解热镇痛药对症处理。如果附睾疼痛较重可请专科医师予1％利多卡因10～20毫升由睾丸上端处行精索局部封闭，可起到止痛、解除坠胀作用。如果附睾炎性包块增大，阴囊皮肤红肿且有波动感，形成脓肿则须行切开引流。因留置导尿管招致本病者，应拔除尿管。另外，急性期期间要避免性冲动和重体力活动，以免加重感染和症状。对少数顽固病人且病情控制不理想，可行附睾甚至包括睾丸切除术。
因慢性附睾炎常与慢性前列腺炎同时存在，所以治疗时二病同治。
(1)注意生活规律化，劳逸结合，忌烟酒及辛辣刺激。
(2)保持大便通畅。
(3)避免长时间久坐。
(4)性生活不宜过频。
(5)温水坐浴，2次／日，水温控制在42℃～50℃，每次20～30分钟。
(6)黄连素或新霉素离子透入。
如果慢性附睾炎有多次反复发作者，可考虑做附睾切除。值得重视的是，无论急性还是慢性附睾炎，如为双侧发生，均有导致不育的可能，故发生附睾炎应及时治疗。