桥本甲状腺炎一般不能自行缓解。部分患者临床症状和清理活检长期不变；有些患者发展为结节性甲状腺肿；约30％～40％以上患者经过一段稳定期或不知不觉中，发展成为永久性甲状腺功能减退症；桥本甲腺炎患者，若甲状腺功能正常，一般不需要特殊治疗；对甲状腺功能减退者以及病程不长的甲状腺肿者，应予以甲状腺激素制剂治疗。一般采用干甲状腺片或左旋甲状腺素。剂量视病情反应而定，宜从小剂量开始，以后逐渐增加。疗程视病情而定，有时需终身服药。药物的应用一定要在医生的指导下进行，否则容易出现甲状腺中毒现象。