肝内肝管结石的诊断易，治疗则较困难，主要有外科手术治疗和保守治疗，外科治疗主要是清除结石，解除胆管狭窄和通畅引流，根据病人的具体情况而确定手术方案，但肝胆管病变复杂，再次手术率较高。还有内镜取石，其成功率与操作者的熟练程度密切相关。 保守治疗有一般治疗和药物治疗，一般治疗包括养成良好的生活习惯，按时起居，劳逸结合，饮食荤素搭配合理，保持乐观积极的良好心态等。药物治疗：目前尚无肯定能溶肝内胆管结石的西药，故治疗口服药物效果差，主要应以中药治疗为主，中医治疗肝内胆管结石要辨证与辨病相结合，即在中医辨证的基础上加用一些能够促进胆汁分泌和排泄的药物。肝内胆管结石临床常见中医辨证分型有：气滞型、湿热型、阴虚型、气虚型、混合型等，用药正确是保证结石能够溶解或排出的前提，治疗疗程一般 3 个月，效果较好的 1 个月左右即可见肝内胆管结石消失，也有部分病人肝内胆管结石很难排出，但服药后临床症状改善，能防止结石的进一步增多，对减少感染的急性发作次数均有作用。