巴氏腺囊肿形成后可持续存在很长时间，发展缓慢，患者一般没有什么不适感，只是觉得一侧阴唇较另一侧肿大。妇科检查可见：患侧大阴唇下1/3部肿大，有囊性感，无明显压痛，阴道口被挤向健侧。
由于巴氏腺囊肿可以长期存在，多年不变，如果不妨碍日常生活，则可以定期观察，无需治疗。如果囊肿逐渐增大，或反复感染，经常形成脓肿，可行巴氏腺囊肿造口术，既保留了腺体功能，又引流通畅，防止复发。治疗后，外阴局部应保持清洁卫生，不穿化纤内裤，经常换洗内裤，避免阴道分泌物、尿液、粪便的污染。
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